Il 23 aprile 1999 la Congregazione per l’Educazione Cattolica ha eretto inoltre l’Istituto Superiore di Scienze Religiose collegato alla Facoltà di Teologia con potere di conferire il grado accademico di Magisterium in Scientiis Religiosis. Il 10 marzo 2008 è stato ratificato il potere di conferire i gradi accademici di Baccalaureato e Licenza.
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